MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei MSHR305 chromosome 1

Total Repeats: 18102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021877	CG	3	6	414	419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021877	GC	5	10	446	455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021877	CGGCG	2	10	470	479	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_021877	CGGC	2	8	535	542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021877	CG	3	6	543	548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021877	GC	3	6	559	564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021877	CGT	2	6	568	573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021877	CG	4	8	584	591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021877	GCC	2	6	606	611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_021877	CG	3	6	612	617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021877	CGA	2	6	658	663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021877	CGC	2	6	677	682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_021877	GCCG	2	8	686	693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021877	GCC	2	6	695	700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_021877	GC	4	8	730	737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021877	CG	3	6	748	753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021877	CAG	2	6	755	760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021877	GGC	2	6	775	780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021877	GC	4	8	779	786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021877	GCC	2	6	796	801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_021877	GCA	2	6	811	816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021877	CGTG	2	8	841	848	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021877	TGA	2	6	862	867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021877	GCC	2	6	875	880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_021877	CAG	2	6	887	892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021877	GCA	2	6	937	942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021877	TCG	2	6	946	951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021877	GCC	2	6	968	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_021877	GCA	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021877	CAG	2	6	1067	1072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021877	CG	3	6	1113	1118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021877	CG	4	8	1120	1127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021877	AGC	2	6	1140	1145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021877	GCC	2	6	1157	1162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_021877	GCA	2	6	1225	1230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021877	GC	3	6	1243	1248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021877	GCGTC	2	10	1372	1381	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_021877	AGC	2	6	1404	1409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021877	GC	4	8	1434	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021877	CG	4	8	1448	1455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021877	CGG	2	6	1469	1474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021877	GGC	2	6	1486	1491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021877	CG	3	6	1524	1529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021877	GGCG	2	8	1565	1572	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_021877	AGC	2	6	1947	1952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021877	CGA	2	6	1957	1962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021877	TCGA	2	8	1983	1990	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021877	TGCG	2	8	2094	2101	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021877	CGC	2	6	2159	2164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_021877	CGA	2	6	2183	2188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021877	GAA	2	6	2189	2194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021877	CGT	2	6	3616	3621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021877	GC	4	8	3653	3660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021877	GCG	2	6	4342	4347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021877	CGG	2	6	4363	4368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021877	GGTC	2	8	4375	4382	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021877	CGC	2	6	4397	4402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_021877	GGCG	2	8	4406	4413	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021877	CG	4	8	4438	4445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021877	GCC	2	6	4460	4465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_021877	GC	4	8	4483	4490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021877	TCG	2	6	4494	4499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021877	CGT	2	6	4582	4587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021877	CGGC	2	8	4588	4595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021877	GCG	2	6	4623	4628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021877	CG	3	6	4627	4632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_021877	GC	3	6	4652	4657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_021877	CG	4	8	4676	4683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021877	CGG	3	9	4690	4698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021877	GTTC	2	8	4717	4724	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_021877	GCG	2	6	4729	4734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021877	GC	3	6	4741	4746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_021877	TCGC	2	8	4747	4754	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021877	CG	3	6	4764	4769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021877	GCA	2	6	4780	4785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021877	GCC	2	6	4802	4807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_021877	CG	3	6	4829	4834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021877	GCG	2	6	4837	4842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021877	GAC	2	6	4880	4885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021877	TGA	2	6	10487	10492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021877	GCGG	2	8	10494	10501	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_021877	GC	3	6	10506	10511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021877	CACG	2	8	10515	10522	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021877	CGG	2	6	10524	10529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021877	GC	3	6	10545	10550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021877	CGG	2	6	10559	10564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021877	GCG	2	6	10586	10591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021877	CGG	2	6	10592	10597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021877	GGC	2	6	10605	10610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021877	TGC	2	6	10623	10628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021877	GCCGAA	6	36	10630	10665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021877	GCCGAT	4	24	10666	10689	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021877	GAAGCT	3	18	10693	10710	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021877	GCCCTA	2	12	10726	10737	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021877	GTC	2	6	10750	10755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021877	CG	3	6	11002	11007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021877	CGG	2	6	11024	11029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021877	CGGC	2	8	11074	11081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021877	GTC	2	6	11097	11102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021877	CG	3	6	11116	11121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021877	TGCG	2	8	11132	11139	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021877	GCC	2	6	11157	11162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_021877	CG	3	6	11207	11212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021877	CGG	2	6	11235	11240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021877	GCAAC	2	10	11255	11264	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_021877	GCC	2	6	11314	11319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_021877	GCC	2	6	11321	11326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_021877	GCC	2	6	11328	11333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_021877	GCC	2	6	11335	11340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_021877	GCC	2	6	11342	11347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_021877	GCC	2	6	11349	11354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_021877	GCC	2	6	11356	11361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_021877	CGGG	2	8	12030	12037	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_021877	T	6	6	12055	12060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021877	AATC	2	8	20673	20680	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021877	CTT	2	6	20691	20696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021877	ATT	2	6	20797	20802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021877	TGT	2	6	20821	20826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021877	TCAA	2	8	20972	20979	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_021877	ATC	2	6	21047	21052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021877	ATG	2	6	21060	21065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021877	AAAT	2	8	21104	21111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021877	GC	3	6	21152	21157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021877	AT	3	6	21180	21185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021877	AAT	2	6	21188	21193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021877	CGC	2	6	21280	21285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_021877	AGC	2	6	21286	21291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021877	GC	3	6	21321	21326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_021877	CGA	2	6	21354	21359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021877	TCG	2	6	21410	21415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021877	CGT	2	6	21427	21432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021877	CCG	2	6	21444	21449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_021877	GC	3	6	21484	21489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021877	GCA	2	6	21526	21531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021877	GCG	2	6	21550	21555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021877	GCG	2	6	21566	21571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_021877	GC	4	8	21596	21603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021877	TTCGGC	2	12	21638	21649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_021877	GGC	2	6	21653	21658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_021877	CGC	2	6	21668	21673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_021877	CGA	2	6	21677	21682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_021877	AACG	2	8	21683	21690	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021877	CGTGC	2	10	21692	21701	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_021877	CGG	2	6	21704	21709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_021877	CGG	2	6	21712	21717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_021877	CGC	2	6	21736	21741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_021877	GC	3	6	21740	21745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021877	GCC	2	6	21748	21753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_021877	TTC	2	6	21783	21788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_021877	GC	4	8	22550	22557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
151	NC_021877	GC	3	6	22564	22569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_021877	CGC	4	12	22567	22578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_021877	GC	3	6	22577	22582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_021877	GC	3	6	22591	22596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_021877	CG	3	6	22600	22605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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157	NC_021877	CG	3	6	22641	22646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
158	NC_021877	GC	5	10	22659	22668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_021877	GCG	2	6	22670	22675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_021877	CGC	2	6	22756	22761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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164	NC_021877	AG	3	6	22878	22883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
165	NC_021877	CCT	2	6	22885	22890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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174	NC_021877	CGG	2	6	27161	27166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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178	NC_021877	GC	3	6	27248	27253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
179	NC_021877	CGC	2	6	27256	27261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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182	NC_021877	CGA	2	6	27316	27321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_021877	CGC	2	6	27346	27351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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188	NC_021877	TCGG	2	8	27484	27491	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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191	NC_021877	GC	3	6	27550	27555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
192	NC_021877	GACA	2	8	27559	27566	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
193	NC_021877	CGAA	2	8	27573	27580	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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195	NC_021877	GGC	2	6	27720	27725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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199	NC_021877	GC	3	6	29038	29043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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245	NC_021877	GC	3	6	35242	35247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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282	NC_021877	GC	4	8	39811	39818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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288	NC_021877	GCG	2	6	41322	41327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_021877	GT	3	6	41367	41372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
290	NC_021877	GCC	2	6	41379	41384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
291	NC_021877	CG	3	6	41389	41394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
292	NC_021877	GCG	3	9	41392	41400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_021877	CG	4	8	41399	41406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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436	NC_021877	GTC	2	6	69704	69709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
437	NC_021877	TCGTG	2	10	69713	69722	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
438	NC_021877	GGA	2	6	69811	69816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
439	NC_021877	AC	3	6	70031	70036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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